Protein–RNA interactions for Protein: B9EK86

Vmn1r180, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r180B9EK86 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Vmn1r180B9EK86 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Vmn1r180B9EK86 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms