Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Siah3B2RWG3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Siah3B2RWG3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms