Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
1700018F24RikB2RW27 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
1700018F24RikB2RW27 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
1700018F24RikB2RW27 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
1700018F24RikB2RW27 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
1700018F24RikB2RW27 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
1700018F24RikB2RW27 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
1700018F24RikB2RW27 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
1700018F24RikB2RW27 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
1700018F24RikB2RW27 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
1700018F24RikB2RW27 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
1700018F24RikB2RW27 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
1700018F24RikB2RW27 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
1700018F24RikB2RW27 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
1700018F24RikB2RW27 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
1700018F24RikB2RW27 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
1700018F24RikB2RW27 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
1700018F24RikB2RW27 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
1700018F24RikB2RW27 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
1700018F24RikB2RW27 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
1700018F24RikB2RW27 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
1700018F24RikB2RW27 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
1700018F24RikB2RW27 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
1700018F24RikB2RW27 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
1700018F24RikB2RW27 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
1700018F24RikB2RW27 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
1700018F24RikB2RW27 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
1700018F24RikB2RW27 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
1700018F24RikB2RW27 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
1700018F24RikB2RW27 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
1700018F24RikB2RW27 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
1700018F24RikB2RW27 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
1700018F24RikB2RW27 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
1700018F24RikB2RW27 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
1700018F24RikB2RW27 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700018F24RikB2RW27 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms