Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Znf518bB2RRE4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Znf518bB2RRE4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Znf518bB2RRE4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Znf518bB2RRE4 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Znf518bB2RRE4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Znf518bB2RRE4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Znf518bB2RRE4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Znf518bB2RRE4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Znf518bB2RRE4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Znf518bB2RRE4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Znf518bB2RRE4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Znf518bB2RRE4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Znf518bB2RRE4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms