Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BC035947B2RQY6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BC035947B2RQY6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BC035947B2RQY6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BC035947B2RQY6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BC035947B2RQY6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
BC035947B2RQY6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BC035947B2RQY6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BC035947B2RQY6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BC035947B2RQY6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BC035947B2RQY6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
BC035947B2RQY6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
BC035947B2RQY6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
BC035947B2RQY6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BC035947B2RQY6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
BC035947B2RQY6 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
BC035947B2RQY6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms