Protein–RNA interactions for Protein: B1B212

H60b, Histocompatibility antigen 60b, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60bB1B212 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H60bB1B212 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H60bB1B212 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H60bB1B212 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H60bB1B212 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H60bB1B212 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
H60bB1B212 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H60bB1B212 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H60bB1B212 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H60bB1B212 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H60bB1B212 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H60bB1B212 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H60bB1B212 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H60bB1B212 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
H60bB1B212 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H60bB1B212 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
H60bB1B212 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H60bB1B212 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H60bB1B212 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H60bB1B212 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H60bB1B212 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
H60bB1B212 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H60bB1B212 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H60bB1B212 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
H60bB1B212 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms