Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9E8

Ttll6, Tubulin polyglutamylase TTLL6, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll6A4Q9E8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ttll6A4Q9E8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ttll6A4Q9E8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms