Protein–RNA interactions for Protein: A2AE42

Cyb561d1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561d1A2AE42 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cyb561d1A2AE42 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cyb561d1A2AE42 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms