Protein–RNA interactions for Protein: A2AB62

1700023F06Rik, RIKEN cDNA 1700023F06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700023F06RikA2AB62 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
1700023F06RikA2AB62 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
1700023F06RikA2AB62 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms