Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gm5114W4VSN8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm5114W4VSN8 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm5114W4VSN8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm5114W4VSN8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5114W4VSN8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5114W4VSN8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5114W4VSN8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5114W4VSN8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5114W4VSN8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm5114W4VSN8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms