Protein–RNA interactions for Protein: S4R1A3

Gm26992, Predicted gene, 26992 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm26992S4R1A3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm26992S4R1A3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm26992S4R1A3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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