Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUDCQ9Y266 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUDCQ9Y266 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms