Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap4s1Q9WVL1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap4s1Q9WVL1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap4s1Q9WVL1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap4s1Q9WVL1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap4s1Q9WVL1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap4s1Q9WVL1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap4s1Q9WVL1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap4s1Q9WVL1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap4s1Q9WVL1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap4s1Q9WVL1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ap4s1Q9WVL1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ap4s1Q9WVL1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ap4s1Q9WVL1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ap4s1Q9WVL1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ap4s1Q9WVL1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ap4s1Q9WVL1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ap4s1Q9WVL1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ap4s1Q9WVL1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ap4s1Q9WVL1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms