Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZK7

Dok3, Docking protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dok3Q9QZK7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Dok3Q9QZK7 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dok3Q9QZK7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dok3Q9QZK7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dok3Q9QZK7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
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Dok3Q9QZK7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Dok3Q9QZK7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
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Dok3Q9QZK7 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Dok3Q9QZK7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dok3Q9QZK7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Dok3Q9QZK7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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Dok3Q9QZK7 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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Dok3Q9QZK7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dok3Q9QZK7 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dok3Q9QZK7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dok3Q9QZK7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dok3Q9QZK7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dok3Q9QZK7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dok3Q9QZK7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dok3Q9QZK7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dok3Q9QZK7 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dok3Q9QZK7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dok3Q9QZK7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dok3Q9QZK7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dok3Q9QZK7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
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Dok3Q9QZK7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
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Dok3Q9QZK7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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Dok3Q9QZK7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
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Dok3Q9QZK7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dok3Q9QZK7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dok3Q9QZK7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Dok3Q9QZK7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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Dok3Q9QZK7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dok3Q9QZK7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dok3Q9QZK7 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dok3Q9QZK7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dok3Q9QZK7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dok3Q9QZK7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dok3Q9QZK7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dok3Q9QZK7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dok3Q9QZK7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dok3Q9QZK7 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Dok3Q9QZK7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dok3Q9QZK7 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dok3Q9QZK7 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dok3Q9QZK7 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Dok3Q9QZK7 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms