Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYL0

Hils1, Spermatid-specific linker histone H1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hils1Q9QYL0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hils1Q9QYL0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hils1Q9QYL0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms