Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY80

Hacd1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd1Q9QY80 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hacd1Q9QY80 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hacd1Q9QY80 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms