Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Psma6Q9QUM9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psma6Q9QUM9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psma6Q9QUM9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psma6Q9QUM9 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psma6Q9QUM9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psma6Q9QUM9 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psma6Q9QUM9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psma6Q9QUM9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psma6Q9QUM9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psma6Q9QUM9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psma6Q9QUM9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psma6Q9QUM9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psma6Q9QUM9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psma6Q9QUM9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psma6Q9QUM9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psma6Q9QUM9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psma6Q9QUM9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Psma6Q9QUM9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psma6Q9QUM9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psma6Q9QUM9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psma6Q9QUM9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psma6Q9QUM9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psma6Q9QUM9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psma6Q9QUM9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psma6Q9QUM9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psma6Q9QUM9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Psma6Q9QUM9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psma6Q9QUM9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psma6Q9QUM9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psma6Q9QUM9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psma6Q9QUM9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psma6Q9QUM9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psma6Q9QUM9 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psma6Q9QUM9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psma6Q9QUM9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Psma6Q9QUM9 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psma6Q9QUM9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Psma6Q9QUM9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms