Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KLHL9Q9P2J3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
KLHL9Q9P2J3 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms