Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trappc2lQ9JME7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trappc2lQ9JME7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trappc2lQ9JME7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms