Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LitafQ9JLJ0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
LitafQ9JLJ0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms