Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLH8

Tmod4, Tropomodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod4Q9JLH8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tmod4Q9JLH8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tmod4Q9JLH8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmod4Q9JLH8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tmod4Q9JLH8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmod4Q9JLH8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmod4Q9JLH8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmod4Q9JLH8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmod4Q9JLH8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tmod4Q9JLH8 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmod4Q9JLH8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmod4Q9JLH8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmod4Q9JLH8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmod4Q9JLH8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmod4Q9JLH8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmod4Q9JLH8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmod4Q9JLH8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tmod4Q9JLH8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmod4Q9JLH8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmod4Q9JLH8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmod4Q9JLH8 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmod4Q9JLH8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmod4Q9JLH8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmod4Q9JLH8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmod4Q9JLH8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmod4Q9JLH8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmod4Q9JLH8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tmod4Q9JLH8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmod4Q9JLH8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmod4Q9JLH8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmod4Q9JLH8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmod4Q9JLH8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmod4Q9JLH8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmod4Q9JLH8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmod4Q9JLH8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmod4Q9JLH8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmod4Q9JLH8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmod4Q9JLH8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tmod4Q9JLH8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms