Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLC8

Sacs, Sacsin, mousemouse

Predictions only

Length 4,582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SacsQ9JLC8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SacsQ9JLC8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SacsQ9JLC8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
SacsQ9JLC8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SacsQ9JLC8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SacsQ9JLC8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
SacsQ9JLC8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SacsQ9JLC8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SacsQ9JLC8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SacsQ9JLC8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
SacsQ9JLC8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SacsQ9JLC8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
SacsQ9JLC8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
SacsQ9JLC8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SacsQ9JLC8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
SacsQ9JLC8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC12□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
SacsQ9JLC8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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