Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gde1Q9JL56 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gde1Q9JL56 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gde1Q9JL56 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms