Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKW0

Arl6ip1, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6ip1Q9JKW0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Arl6ip1Q9JKW0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Arl6ip1Q9JKW0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms