Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL5

Tulp4, Tubby-related protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp4Q9JIL5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tulp4Q9JIL5 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tulp4Q9JIL5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tulp4Q9JIL5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms