Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf2ird1Q9JI57 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms