Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm7Q9ESD6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm7Q9ESD6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm7Q9ESD6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm7Q9ESD6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm7Q9ESD6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm7Q9ESD6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm7Q9ESD6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm7Q9ESD6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm7Q9ESD6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm7Q9ESD6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm7Q9ESD6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm7Q9ESD6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm7Q9ESD6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cmtm7Q9ESD6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm7Q9ESD6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm7Q9ESD6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm7Q9ESD6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm7Q9ESD6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm7Q9ESD6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm7Q9ESD6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm7Q9ESD6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm7Q9ESD6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm7Q9ESD6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cmtm7Q9ESD6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cmtm7Q9ESD6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cmtm7Q9ESD6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cmtm7Q9ESD6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cmtm7Q9ESD6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms