Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Wdr61Q9ERF3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Wdr61Q9ERF3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Wdr61Q9ERF3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Wdr61Q9ERF3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Wdr61Q9ERF3 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Wdr61Q9ERF3 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Wdr61Q9ERF3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Wdr61Q9ERF3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Wdr61Q9ERF3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Wdr61Q9ERF3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Wdr61Q9ERF3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Wdr61Q9ERF3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Wdr61Q9ERF3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Wdr61Q9ERF3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Wdr61Q9ERF3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Wdr61Q9ERF3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Wdr61Q9ERF3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Wdr61Q9ERF3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Wdr61Q9ERF3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Wdr61Q9ERF3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Wdr61Q9ERF3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Wdr61Q9ERF3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Wdr61Q9ERF3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Wdr61Q9ERF3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Wdr61Q9ERF3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Wdr61Q9ERF3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Wdr61Q9ERF3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Wdr61Q9ERF3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Wdr61Q9ERF3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Wdr61Q9ERF3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Wdr61Q9ERF3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms