Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

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Length 502 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tfcp2Q9ERA0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tfcp2Q9ERA0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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