Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gpr88Q9EPB7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gpr88Q9EPB7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpr88Q9EPB7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpr88Q9EPB7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpr88Q9EPB7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpr88Q9EPB7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpr88Q9EPB7 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpr88Q9EPB7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpr88Q9EPB7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpr88Q9EPB7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpr88Q9EPB7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpr88Q9EPB7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpr88Q9EPB7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gpr88Q9EPB7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gpr88Q9EPB7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpr88Q9EPB7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Gpr88Q9EPB7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpr88Q9EPB7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpr88Q9EPB7 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Gpr88Q9EPB7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gpr88Q9EPB7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms