Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc97Q9DBT3 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc97Q9DBT3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms