Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAC0

Cmtm2b, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2bQ9DAC0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cmtm2bQ9DAC0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cmtm2bQ9DAC0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms