Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc89Q9DA73 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc89Q9DA73 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms