Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Chmp4bQ9D8B3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chmp4bQ9D8B3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms