Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gbe1Q9D6Y9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gbe1Q9D6Y9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms