Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Sf3a3Q9D554 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sf3a3Q9D554 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sf3a3Q9D554 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sf3a3Q9D554 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Sf3a3Q9D554 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3a3Q9D554 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3a3Q9D554 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3a3Q9D554 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3a3Q9D554 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3a3Q9D554 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3a3Q9D554 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3a3Q9D554 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3a3Q9D554 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3a3Q9D554 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3a3Q9D554 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3a3Q9D554 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3a3Q9D554 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3a3Q9D554 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Sf3a3Q9D554 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3a3Q9D554 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3a3Q9D554 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3a3Q9D554 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3a3Q9D554 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms