Protein–RNA interactions for Protein: Q9D476

4933407L21Rik, RIKEN cDNA 4933407L21 gene, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933407L21RikQ9D476 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
4933407L21RikQ9D476 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4933407L21RikQ9D476 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms