Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Rsph14Q9D3W1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rsph14Q9D3W1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms