Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3F6

Ms4a4c, MCG12897, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4cQ9D3F6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ms4a4cQ9D3F6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Gm14542-201ENSMUST00000118460 1248 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ms4a4cQ9D3F6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms