Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E6

Tbcb, Tubulin-folding cofactor B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TbcbQ9D1E6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TbcbQ9D1E6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TbcbQ9D1E6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TbcbQ9D1E6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TbcbQ9D1E6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TbcbQ9D1E6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TbcbQ9D1E6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TbcbQ9D1E6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TbcbQ9D1E6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TbcbQ9D1E6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TbcbQ9D1E6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TbcbQ9D1E6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TbcbQ9D1E6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TbcbQ9D1E6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TbcbQ9D1E6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TbcbQ9D1E6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TbcbQ9D1E6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TbcbQ9D1E6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TbcbQ9D1E6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TbcbQ9D1E6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TbcbQ9D1E6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TbcbQ9D1E6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TbcbQ9D1E6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TbcbQ9D1E6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TbcbQ9D1E6 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TbcbQ9D1E6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TbcbQ9D1E6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TbcbQ9D1E6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TbcbQ9D1E6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TbcbQ9D1E6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TbcbQ9D1E6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TbcbQ9D1E6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TbcbQ9D1E6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TbcbQ9D1E6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TbcbQ9D1E6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TbcbQ9D1E6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TbcbQ9D1E6 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TbcbQ9D1E6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TbcbQ9D1E6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms