Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Nip7Q9CXK8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Nip7Q9CXK8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Nip7Q9CXK8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms