Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atp5sQ9CRA7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Atp5sQ9CRA7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms