Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQV6

Map1lc3b, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3B, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1lc3bQ9CQV6 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Map1lc3bQ9CQV6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Map1lc3bQ9CQV6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Map1lc3bQ9CQV6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Map1lc3bQ9CQV6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Map1lc3bQ9CQV6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Map1lc3bQ9CQV6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Map1lc3bQ9CQV6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Map1lc3bQ9CQV6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Map1lc3bQ9CQV6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Map1lc3bQ9CQV6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Map1lc3bQ9CQV6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Map1lc3bQ9CQV6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Map1lc3bQ9CQV6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Map1lc3bQ9CQV6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Map1lc3bQ9CQV6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Map1lc3bQ9CQV6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Map1lc3bQ9CQV6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Map1lc3bQ9CQV6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Map1lc3bQ9CQV6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Map1lc3bQ9CQV6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Map1lc3bQ9CQV6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Map1lc3bQ9CQV6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Map1lc3bQ9CQV6 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Map1lc3bQ9CQV6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Map1lc3bQ9CQV6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Map1lc3bQ9CQV6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Map1lc3bQ9CQV6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Map1lc3bQ9CQV6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Map1lc3bQ9CQV6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Map1lc3bQ9CQV6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Map1lc3bQ9CQV6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms