Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nicn1Q9CQM0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Nicn1Q9CQM0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Nicn1Q9CQM0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Nicn1Q9CQM0 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Nicn1Q9CQM0 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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Nicn1Q9CQM0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Nicn1Q9CQM0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Nicn1Q9CQM0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nicn1Q9CQM0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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