Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdzk1ip1Q9CQH0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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