Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rab5aQ9CQD1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rab5aQ9CQD1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms