Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
1700029P11RikQ9CQ68 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
1700029P11RikQ9CQ68 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms