Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Commd4Q9CQ02 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Commd4Q9CQ02 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms