Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPV1

Ska1, Spindle and kinetochore-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska1Q9CPV1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ska1Q9CPV1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ska1Q9CPV1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ska1Q9CPV1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ska1Q9CPV1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ska1Q9CPV1 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ska1Q9CPV1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ska1Q9CPV1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ska1Q9CPV1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ska1Q9CPV1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ska1Q9CPV1 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ska1Q9CPV1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ska1Q9CPV1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ska1Q9CPV1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Ska1Q9CPV1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms