Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt88Q9CPR6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt88Q9CPR6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt88Q9CPR6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt88Q9CPR6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt88Q9CPR6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt88Q9CPR6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt88Q9CPR6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt88Q9CPR6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt88Q9CPR6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt88Q9CPR6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt88Q9CPR6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt88Q9CPR6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt88Q9CPR6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt88Q9CPR6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt88Q9CPR6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt88Q9CPR6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt88Q9CPR6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt88Q9CPR6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt88Q9CPR6 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt88Q9CPR6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt88Q9CPR6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt88Q9CPR6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt88Q9CPR6 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt88Q9CPR6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt88Q9CPR6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt88Q9CPR6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt88Q9CPR6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt88Q9CPR6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt88Q9CPR6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt88Q9CPR6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt88Q9CPR6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt88Q9CPR6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt88Q9CPR6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Krt88Q9CPR6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt88Q9CPR6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt88Q9CPR6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt88Q9CPR6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt88Q9CPR6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Krt88Q9CPR6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms